（五十音順） 2024年4月
| 役職 | 氏名 | 職名 |
|---|---|---|
| 代表理事（理事長） | 茂木 友三郎 | キッコーマン(株)取締役名誉会長・取締役会議長 |
| 執行理事（専務理事） | 今井 泰彦 | |
| 理事 | 江﨑 信芳 | 京都大学名誉教授 |
| 太田 明徳 | 中部大学監事 東京大学名誉教授 | |
| 長田 裕之 | （公財）微生物研究会 微生物化学研究所 特任部長 | |
| 五味 勝也 | 東北大学名誉教授 | |
| 中村 聡 | 東京工業大学名誉教授 沼津工業高等専門学校名誉教授 | |
| 原島 俊 | 崇城大学特任教授 大阪大学名誉教授 | |
| 松山 旭 | キッコーマン(株)取締役常務執行役員研究開発本部長 | |
| 監事 | 飯島 信司 | 愛知工業大学客員教授 名古屋大学名誉教授 |
| 森 孝一 | キッコーマン(株)常勤監査役 | |
| 評議員 | 石井 正治 | 東京大学名誉教授 |
| 梶山 直樹 | キッコーマンバイオケミファ(株)代表取締役社長 | |
| 木野 邦器 | 早稲田大学教授 | |
| 小林 哲夫 | 名古屋大学名誉教授 | |
| 阪井 康能 | 京都大学教授 | |
| 佐藤 隆一郎 | 東京大学特任教授 | |
| 竹川 薫 | 九州大学教授 | |
| 西山 真 | 東京大学教授 | |
| 半谷 吉識 | キッコーマン食品(株)品質保証部長 | |
| 堀切 功章 | キッコーマン(株)代表取締役会長 | |
| 名誉理事 | 荒井 綜一 | 元東京大学教授 |
| 石川 雄章 | (公財)日本醸造協会顧問 | |
| 一島 英治 | 東北大学名誉教授 東京農工大学名誉教授 | |
| 魚住 武司 | 東京大学名誉教授 | |
| 神尾 好是 | 東北大学名誉教授 尚絅学院大学名誉教授 | |
| 上野川 修一 | 東京大学名誉教授 | |
| 児玉 徹 | 東京大学名誉教授 | |
| 高橋 秀夫 | 東京大学名誉教授 | |
| 塚越 規弘 | 名古屋大学名誉教授 | |
| 永井 和夫 | 中部大学名誉教授 東京工業大学名誉教授 | |
| 山崎 眞狩 | 東京大学名誉教授 | |
| 顧問 | 近藤 忠男 | 元キッコーマン(株)代表取締役専務執行役員 |
| 研究所長 | 今井 泰彦 |
| 事務局長 | 篠崎 洋平 |